Биткойн е проектиран, за да позволява изпращането и получаването на парични преводи с приемливо ниво на анонимност. Въпреки това Биткойн не е анонимен и не притежава нивото на анонимност, което имат парите в кеш. Използването на Биткойн оставя съществени общодостъпни следи. Съществуват различни механизми за защита на анонимността на потребителите, като има и такива, които в момента са в процес на разработка. Въпреки това все още предстои да бъде свършена доста работа преди да бъде възможно тези механизми да започнат да бъдат коректно използвани от потребителите на Биткойн.

Съществуват опасения, че личните транзакции, възможни в Биткойн мрежата, може да бъдат използвани за незаконни цели. Важно е да се отбележи, че Биткойн със сигурност ще стане обект на същите регулации, вече приложени в съществуващите финансови системи. Биткойн не може да бъде по-анонимен от парите в кеш и използването му не може да възпрепятства провеждането на криминални разследвания. Също така, Биткойн е създаден, за да предотвратява голям брой видове финансови измами.